Las sustituciones de los profesores de baja están reguladas por normativa estatal que todas las Comunidades Autónomas estamos obligadas a cumplir, y la normativa decía hasta ahora que las sustituciones se producirían únicamente cuando hubieran transcurrido diez días lectivos desde la baja. Esta normativa se ha modificado y desde este mismo año 2016 los profesores se pueden sustituir de forma inmediata en casos prioritarios, como es el del segundo curso de Bachillerato. Por lo tanto, la situación que nos comentas ya no tendría que producirse. De todas formas, si nos das más datos podemos estudiar exactamente lo que ha pasado.

Un saludo.